中心依托学院大型分析实验平台，同时建成有机碳形态和组分、微生物培养和分析、物质迁移转化等分析和实验平台。常用仪器包括MAT-253plus、ICP-OES、离子色谱仪、气相色谱仪、LGR、总有机碳分析仪、电感耦合离子光谱仪、红外光谱仪、荧光光谱仪、傅里叶红外光谱仪、光照培养箱、无菌超净台、PCR仪、荧光定量PCR仪、酶标仪等。
